استخدام حقن منع الحمل له العديد من الآثار السلبية، كتوقف التبويض واضطراب الدورة الشهرية وزيادة الوزن، ولكنها لا تسبب العقم الكامل كما هو شائع عنها، وينصح بعدم استخدامها لأكثر من عامين متتاليين.
هناك العديد من العيوب الخلقية والأمراض التى قد تصيب الرحم وتؤثر على فرص حدوث الحمل واكتماله.