تتم بشكل مستمر أعمال نقل القطع الأثرية من المواقع والمتاحف المختلفة إلى المتحف المصرى الكبير، وذلك بعد اختيارها من خلال لجنة مشكلة من المتحف، ليتم في البداية عمل مجموعة من الدراسات والتوثيق لكل قطعة بشكل منفصل، وذلك لوضعها على قاعدة بيانات المتحف الكبير، ولكن ما الذى يتم لحظة اتخاذ قرار نقل القطع؟.
المتبع دائمًا عند نقل أي قطعة أثرية إلى المتحف المصرى الكبير، هو تغليفها أولاً أي قبل أعمال النقل تتم عملية تغليف كل قطعة داخل قميص مبطن بالفوم، كما تقوم اللجنة المختصة بأعمال النقل إجراء مسح رادارى شامل قبل عملية النقل وتوثيق ثلاثى الأبعاد للوقوف على أماكن الضعف والقوة بها، وذلك من خلال الحرص على إتباع أعلى معدلات الأمان فى عمليات الاستلام والتغليف والترميم الأولى لجميع القطع الأثرية الصغيرة والمتوسطة الحجم.
ثم يتم بعد ذلك رفع القطع الأثرية على السيارات الخاصة بأعمال النقل والتي تحوى مواصفات الغرض منها الحفاظ على سلامة القطع، وتتم عمليات رفع القطع واستقرارها على السيارات المجهزة لذلك، والسير بسرعة تتناسب مع طبيعة القطع الأثرية، حرصًا على عدم حدوث أي تلف لأى قطعة، ثم يتم وضع القطع عقب وصولها إلى المتحف داخل معامل مركز الترميم للبدء فى أعمال الترميم والصيانة اللازمة لها.
وتتم أعمال النقل وسط إجراءات أمنية وتحت إشراف اللواء عاطف مفتاح، المشرف العام على مشروع المتحف المصرى الكبير والمنطقة المحيطة.