تعد الكلية الإكليريكية أحد أهم المراكز العلمية لإعداد خدام مكرسين وكهنة، حيث تعتبر بالنسبة للكنيسة العمود الفقرى الذى ينتصب به الجسم.
ووضع الأساس الأول لهذا الصرح، القديس مارمرقس أحد السبعين رسولاً، وكاروز الديار المصرية الذى ترك 3 جواهر ( إنجيل مرقس، والليتورجية "المنسوبة للقديس كيرلس"، والمدرسة اللاهوتية).
وكان أول مدير لهذه المدرسة اللاهوتية القديس العلامة يسطس الذى جلس على كرسى مارمرقس وصار السادس فى عداد البطاركة. وعين القديس أمونيوس مديراً للمدرسة – ولما جلس أمونيوس "السابع" على الكرسى المرقسى عين مركيانوس لإدارة المدرسة وصار مركيانوس الثامن فى عدد البطاركة.
وتخرج فى هذه المدرسة البابا بطرس السابع عشر خاتم الشهداء والبابا أرشيلاوس الثامن عشر والبابا أثناسيوس الرسولى العشرون والبابا تيموثاوس الثانى والعشرون، وعن طريق هذه المدرسة حفظت التعاليم اللاهوتية المسلمة بالتسليم الرسولى.
وتقسم الدراسة فى الكلية إلى قسمين القسم النهارى والقسم المسائى
الشروط العامة للإلتحاق بالقسمين
1 - أن يكون المتقدِم قبطياً أرثوذكسياً، مشهوداً له من أب اعتارفه بتذكية صريحة وواضحة .
2 - ألا يكون المتقِدم من الذين ثبت عليهم أي أحكام جنائية أو كنسية بسبب جرائم مشينة، تمس السمعة أو السلوك.
3 - أن يكون المتقدِم حاصلاً على مؤهل عالٍ، سواء بكالوريوس أو ليسانس من أي كلية أو جامعة أو معهد عالٍ معترف به من وازرة التعليم العالي .
4 - لابد من إجتياز الطالب الاختبار الشخصي الشفهي والتحريري بنجاح.
شروط خاصة بالقسم النهارى فقط
1 - أن يحصل المتقدِم على تذكية صريحة من نيافة مطران أو أسقف الإيبارشية التابع لها يذكيه فيها للإلتحاق بالكلية والانتظام في دراستها، على أن تستفيد به الإيبارشية في الخدمة بعد التخرج.
2 - أن يكون المتقدِم قد أدَّى الخدمة الوطنية العسكرية أو معفى منها إعفاءاً نهائياً .
3 - أن يكون سن المتقِدم لا يزيد في أكتوبر عام التقديم عن 27 سنة لا أكثر.
4 - أن يكون المتقِدم غير مرتبط بخطبة أو زواج قبل الإلتحاق بالكلية، وأن يلتزم بهذا الشرط طوال فترة الد ارسة.
5 - الإقامة بسكن داخلي خلال فترة الدراسة.
الدراسة داخل الكلية الإكليريكية
تبلغ مدة الدراسة بالكلية 4 سنوات، ويحصل بعدها الطالب على بكالوريوس في العلوم اللاهوتية، علاوة على الدراسة فإن طالب القسم النهارى يخضع لبرنامج روحي يومى، من صلوات وقراءة وقداسات، أى أن التكوين يشمل الناحية الروحية والعلمية.
وتعتبر السنة الأولى سنة اختبارية إذا رسب فيها الطالب يفصل نهائيا من الكلية.
ويعتبر الرسوب فى السنوات اللاحقة للسنة الأولى إخفاق الطالب فى أكثر من 3 مواد، وهذا بالنسبة للقسم النهارى، بينما البقاء للإعادة بالنسبة القسم الليلى فإنه بالرسوب فى 5 مواد.
وتولى الكلية اهتماما بالغا بالسلوك لمنضبط للطالب، والذى لا يحصل على التقدير اللائق لا يسمح له بدخول امتحانات آخر العام الد ارسي . وتعطي له فرصة لعام اخر ،لأنه يجب أن يكون قدوة ومثالاً يؤهله بأن يكون خادماً ومسئولاً عن شعب .
بالنسة للإنتظام الد ارسى للطالب: تشترط الكلية نسبة 90% كحد أدنى للحضور، و75 % للقسم المسائى بدونها لا يجوز للطالب أن يتقدم الى امتحان أخر العام مع فرقته.
ويدرس الطالب مواد مثل الكتاب المقدس وأقوال الآباء واللاهوت النظرى والعقيدى والروحى واللاهوت الأدبى والمقارن وتاريخ الأديان وتفسير العهدين الجديد والقديم، بالإضافة إلى علوم الوعظ والتسبحة والألحان والأحوال الشخصية واللغات القبطية والإنجليزية واليونانية والعبرية والعربية وعلم النفس والاجتماع والفلسفة.
