اهتمت وزارة النقل بتطوير الموانئ البحرية بالكامل وكان لموانئ البحر الأحمر نصيب كبير من أعمال التطوير، حيث تم تطوير ميناء نويبع البحري بتكلفة 475 مليون جنيه، وإنشاء مخزن نموذجى بميناء سفاجا على مساحة 5900 م2 بتكلفة 41 مليون جنيه، كما تم انشاء ساحة للشاحنات الثقيلة بميناء سفاجا بتكلفة 39 مليون جنيه، وإنشاء رصيف جديد بميناء سفاجا بطول 65 متر بتكلفة 74 مليون جنيه، وجارى إنشاء محطة جديدة بميناء سفاجا بأطوال أرصفة 1100 متر ومساحة 810 ألف م2 بتكلفة 2.6 مليار جنيه، وجارى انشاء ميناء الصيادين الجديد بتكلفة 300 مليون جنيه.
ويتحول الوضع بالكامل بميناء السخنة، حيث يجرى تطوير ميناء السخنة بإنشاء 18 كم أرصفة جديدة وإضافة 6.3 كم2 مناطق لوجيستية وساحات تداول بمسطح 8.6 مليون متر مربع و3270 متر حواجز أمواج والأراضى المكتسبة خلف الحواجز بمسطح 4 مليون متر مربع و30 كم شبكة سكك حديدية و17 كم طرق خرسانية.
أما ميناء العريش البحرى، يشهد إعادة بناء، حيث تم التخطيط لإنشاء أرصفة جديدة بأطوال 2.25 كم ليصبح إجمالى أطوال الأرصفة 3.665 كم، وجارى إنشاء رصيف البضائع العامة رقم ( 1 ) بطول 250 متر، وإنشاء رصيف البضائع العامة رقم ( 2 ) بطول 1000 متر، ومن المقرر أن يتم إنشاء رصيف متعدد الأغراض بطول 915 متر، كما تم الانتهاء من إنشاء حاجز الأمواج الرئيسى الشمالى بطول 1250 متر وحاجز الأمواج الشرقى بطول 250 مترا.
وفى ميناء برنيس البحرى، تم الانتهاء من إنشاء رصيف متعدد الأغراض بطول 700 متر ( 200 متر ركاب و500 متر بضائع عامة )، وتم الانتهاء من إنشاء رصيف حاويات بطول 500 متر وغاطس 18 مترا.
وتنفذ وزارة النقل مجموعة أهداف استراتيجية فى عدة محاور كان المحور الأول منها خلق ممرات لوجستية دولية تنموية متكاملة لربط مناطق الإنتاج ( الصناعى – الزراعى - التعدينى – الخدمى ) بالموانئ البحرية بوسائل نقل سريعة وآمنة مروراً بالموانئ الجافة والمناطق اللوجستية المتكاملة وهذه الممرات "ممر السخنة – الإسكندرية وممر العريش – طابا وممر القاهرة – الإسكندرية وممر طنطا – المنصورة – دمياط وممر جرجوب – السلوم وممر القاهرة – أسوان – أبو سمبل وممر سفاجا – قنا – أبو طرطور".
وتم التخطيط لإضافة أرصفة جديدة بإجمالى أطوال 67 كم بأعماق تتراوح من (18-22) متر وأهمها موانئ برنيس – سفاجا - السخنة - الأدبية - نويبع على البحر الأحمر وموانئ العريش - بورسعيد - دمياط - أبو قير – الإسكندرية - جرجوب على البحر المتوسط ليصل إجمالى أطوال الأرصفة فى الموانئ البحرية إلى 100 كم بالإضافة إلى إنشاء حواجز أمواج بأطوال 15 كم وتعميق الممرات الملاحية لتستوعب الموانئ 400 مليون طن سنويا بدلا من 185 مليون طن و40 مليون حاوية مكافئة سنويا بدلا من 12 مليون حاوية مكافئة بالإضافة إلى 10 ملايين حاوية ترانزيت و30 ألف سفينة عملاقة سنويا.
