تمتلأ مصر بالعديد من المكتبات التي تضم زخائر من التراث سواء من المخطوطات القديمة أو أمهات الكتب النادرة، ونجحت تلك المكتبات من الغزاة والطامعين والعابثين على مدى قرون من الزمن لتحفظ ذاكرة التاريخ المصري بما تحتويه من مخطوطات ووثائق تأسر ألباب المتجولين داخلها والمنقبين في محتوياتها.
دار الكتب والوثائق
تعد الهيئة العامة لدار الكتب والوثائق القومية أكبر مكتبة قومية للمخطوطات لمصر، وبحسب موقع الهيئة الرسمي، فأن عدد المخطوطات أصبح رصيد الهيئة من المخطوطات 51193 رقم حفظ = 59321 مجلدًا = 88164 عنوانًا، ومكتبتها مثل:المكتبة التيمورية، المكتبة الزكية، مكتبة مصطفى فاضل باشا، مكتبة خليل أغا، صاحب مدرسة الخط المشهورة/ مكتبة الإمام محمد عبده، هذا بخلاف تعدد اللغات مثل العربية والفارسية والتركية، وفى محتلف العلوم، مثل: الطب، والهندسة، والكيمياء، والفلك، والفقه.
مكتبة البلدية بالإسكندرية
محتوى المكتبة من المخطوطات، يجعل منها أكبر خزانة خطية بالإسكندرية، فهى تقتنى ما يزيد عن ستة آلاف مخطوطة، وقد ازداد هذا المحتوى شيئاً فشيئاً بفضل الإهداءات والتبرعات التى كانت تصل للمكتبة منذ إنشائها.
مركز المخطوطات بمكتبة الإسكندرية
قسم المخطوطات الأصلية: ويضم هذا القسم مجموعاتٍ متنوعةً من المخطوطات، منها المخطوطات الأصلية، وعلى رأسها مجموعةُ مكتبة بلدية الإسكندرية، بالإضافة إلى المجموعات المهداة، وهي: مجموعة مخطوطات الشيخ الحصري، ومخطوطات جمعية تحفيظ القرآن بدمنهور، ومصورات مكتبة مالطا، ومخطوطات مهداة من الأفراد، ويضمُّ القسمُ أيضًا قاعةً للاطلاع تضمُّ أمهاتِ المصادر التراثية المطبوعة التي يحتاج إليها الدارسون والباحثون في شتَّى مجالات العمل التراثي.
مكتبة الأزهر الشريف
تضم المكتبة نوادر في كثير من الفنون قل أن تتيسر فى مكتبة أخرى وهى ممثلة فى مؤلفات علماء الجامع الأزهر بصفة خاصة وعلماء الإسلام بصفة عامة، يوجد بالمكتبة قواعد للبيانات المطبوعة والمخطوطة بدأا لعمل بها عام 2001، عدد العناوين المطبوعة بالمكتبة 110000 عنوان تقريبا في حوالي 300000 مجلد، عدد المخطوطات بالمكتبة 50000 مخطوط تقريبا.
مكتبة دير السريان
مكتبة الدير والتى تضم عددًا من المخطوطات النادرة، ضمن 2000 مخطوطة قبطية وعربية وسريانية ويونانية وإثيوبية وبعض القصاصات باللغة اليونانية، وتشكل المخطوطات العربية الأكثرية فيها، تليها المخطوطات السريانية، بينما تمثل المخطوطات الإثيوبية العدد الأقل، وتعتبر مجموعة مخطوطات دير السريان من أقدم وأهم المخطوطات التى تمتلكها الكنيسة القبطية على الإطلاق، حيث يرجع تاريخ أقدم مخطوط بها للقرن الخامس الميلادى، وهو مجلد على رق باللغة السريانية، ويعتبر أقدم مخطوط مسيحى فى العالم كله حتى الآن، وهو نصوص للكتاب المقدس من العهد الجديد، ويرجع تاريخه لعام 459م.
