أنشئت الإدارة العامة لشئون المحاكم المتخصصة بقرار من وزير العدل رقم 6383 لسنة 2011 ، ونصت المادة الثالثة من قرار الوزير على ، يشكل قطاع المحاكم المتخصصة من الإدارات التالية:
1 - الإدارة العامة للمحاكم الاقتصادية
2 - الإدارة العامة لشئون محاكم الأسرة
3 - الإدارة العامة لشئون المحاكم العمالية
4 - الإدارة العامة لشئون مكاتب تسوية المنازعات الأسرية
5 - الإدارة العامة لشئون المساعدة القانونية الأسرية
6 - الإدارة العامة لشئون المساعدة القانونية العمالية
جدير بالذكر ان المادة الأولى من قرار الوزير نصت على ، "يشكل قطاع المحاكم المتخصصة بوزارة العدل برئاسة مساعد وزير العدل من أحد نواب رئيس محكمة النقض أو أحد الرؤساء بمحاكم الاستئناف ويلحق به العدد الكافي من العاملين بوزارة العدل والمحاكم
أما المادة الثانية فنصت على "يشكل مكتب فني لقطاع المحاكم المتخصصة من عدد كاف من السادة القضاة وأعضاء الهيئات القضائية الأخرى بقرار من وزير العدل".
