ساهمت السفارة المصرية في اليابان في مبادرة الحفاظ على البيئة والتشجيع على تدوير المخلفات، وذلك من خلال المشاركة في مشروع تصنيع ميداليات دورة الألعاب الأولمبية "طوكيو 2020".
تزامناً مع تولى مصر رئاسة الاتحاد الإفريقي، اضطلعت السفارة المصرية فى طوكيو بعقد الملتقى الدورى لمجلس السفراء الأفارقة بحضور جميع رؤساء البعثات الإفريقية باليابان..
قامت السفارة المصرية فى طوكيو بتدشين "مجلس علماء المصريات فى اليابان"، والذى يضم فى عضويته عددا من كبار أساتذة الجامعات اليابانية المتخصصين فى هذا المجال.