يعانى البحث العلمى فى مصر من مشكلات كثيرة وفى رأيى أن أهم هذه المشكلات هى:
- عدم وجود قاعدة بيانات واضحة وجادة للإمكانيات البحثية البشرية والمادية داخل المؤسسات البحثية أو داخل الدولة الواحدة.
-افتقاد التعاون الحقيقى بين المؤسسات البحثية المختلفة.
-انشغال الباحثين بالمشاكل الإدارية المختلفة الخاصة بعملهم.
- انشغال الباحثين بالمشاكل المادية المحيطة بهم
-اعتماد الباحثين بشكل كبير على التمويل الحكومى من داخل مؤسساتهم
-عدم توفر قائمة معتمده للجهات الممولة يمكن لجميع الباحثين معرفتها للتقدم اليها فى المواعيد المناسبة
-عدم وجود حوار وجهات منسقة للتعاون المثمر والحقيقى بين مؤسسات المجتمع المدنى والمؤسسات البحثية المختلفة.
-عدم وجود الوعى المجتمعى الكافى بأهمية البحث العلمى وقدرته على حل المشكلات
-كثير من المشاريع البحثية تفتقر إلى القيمة التطبيقية وبالتالى يصعب على المجتمع المدنى استيعاب أهميتها
-عدم قدرة الباحثين على الاستفادة من القدرات الالكترونية للمكتبات الرقمية المتوفرة بجميع الجامعات والمراكز البحثية
-الاستراتيجية الوطنية فى مجال العلم والتكنولوجيا سواء فى الأكاديميات العلمية والهندسية والطبية فى البلد لا تستفيد من خبرات البلدان الأخرى بسبب عدم وجود احتكاك علمى ونقص الخبرة
-الفقر البحثى والعلمى لدى بعض المؤسسات البحثية قد يدفع الباحثين إلى اللجوء إلى الاقتباس والتقليد الأعمى وعدم الإبداع.
-عدم التمييز المادى بين الكفاءات المختلفة داخل المؤسسة العلمية الواحدة.
