تقوم وزارة الآثار فى الوقت الحالى بأعمال ترميم وتطوير قصر محمد على فى شبرا، حيث يتم إجراء أعمال ترميم شاملة، تمهيدًا لافتتاحه للزوار.
وتتضمن أعمال الترميم التى تستمر لمدة عام ونصف إلى عامين تقريبا، والتى بدأت فى الربع الأول من العام الحالى، معالجة المياه الجوفية وتخفيض درجة الرطوبة، ودعم كامل للأساسات وتدعيمها، وتركيب كاميرات للمراقبة، حيث إن القصر تعرض من قبل لمحاولة سرقة وبالتحديد فى 19 سبتمبر 2017، وأن أعضاء لجنة خلال فتح قصر محمد على بشبرا فوجئوا أثناء فتحه بتعرض باب مكتب الأمناء الموجود داخل قصر الفسقية بالقصر وأبواب بعض الحجرات للكسر، وكذلك اختفاء مفاتيح بعض القاعات من الصندوق الخاص بحفظها بعد تعرضه هو الآخر للكسر، وتم إبلاغ شرطة السياحة والآثار والنيابة العامة آنذاك، وتم على الفور صدور قرار إدارى رقم 117 بتشكيل لجنة أثرية من خارج القصر لجرد محتوياته، وجرت تحقيقات موسعة والتى أثبتت عدم وجود نواقص على الإطلاق.
كما أن المتحف مغلق منذ 7 سنوات، بسبب سقوط أحد أسقف الحجرات، وتم إسناد المشروع لشركة هندسية، والتى قامت بالفعل باستلام المتحف، لتطويره وإعادة فتحه مرة أخرى، حيث إن المتحف محط اهتمام رئاسة الوزارة، ومن ضمن المشاريع التى دعمها رئاسة الوزارة بأكثر من مليار جنيه.