فيما يعد تكرارا لأزمة مدينة زويل وجامعة النيل، دخلت جامعة مصر للعلوم والتكنولوجيا نزاعا قانونيا مع الحكومة على الأرض التى اشترتها الجامعة عام 1998، لإنشاء توسعات جديدة لكلياتها، وخاضت الحكومة مع إدارة الجامعة صراعا مباشرا عبر هيئة المجتمعات العمرانية ووزارة الإسكان.